Fondé en 1995 par le député fédéral Charles-Eugène Marin, Explorama, mer, monts et merveilles se donne pour mission, à l’époque, de faire connaître aux visiteurs les merveilles de la Gaspésie. Le centre interprétait la mer, la montagne, ainsi que la culture et l’histoire gaspésienne.

En 2003-2004, le centre entreprend un grand tournant vers la muséologie et les sciences marines.

Aujourd’hui, Exploramer, la mer à découvrir est une institution muséale reconnue par le Ministère de la culture, des communications et de la condition féminine dont la mission est de sensibiliser les publics à la préservation et à la reconnaissance du milieu marin du Saint-Laurent dans l’environnement.

Cette mission est poursuivie à travers les activités de vulgarisation scientifique offertes au musée, au parc aquarium, lors des excursions en mer, de l'Exploration du littoral sous-marin et dans les écoles de la Gaspésie via un programme pédagogique adapté aux différents niveaux scolaires.

Dès l’été 2009, c’est par les papilles qu’Exploramer compte contribuer à un saine gestion des ressources marines. Le programme de certification «Fourchette Bleue, pour une saine gestion des ressources marines», encourage les restaurants et poissonneries du Québec à faire découvrir les espèces comestibles mais méconnues du Saint-Laurent.